Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SrpraQ9DBG7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SrpraQ9DBG7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrpraQ9DBG7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SrpraQ9DBG7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrpraQ9DBG7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrpraQ9DBG7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrpraQ9DBG7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrpraQ9DBG7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrpraQ9DBG7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrpraQ9DBG7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SrpraQ9DBG7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SrpraQ9DBG7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SrpraQ9DBG7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrpraQ9DBG7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrpraQ9DBG7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrpraQ9DBG7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrpraQ9DBG7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrpraQ9DBG7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrpraQ9DBG7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrpraQ9DBG7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrpraQ9DBG7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SrpraQ9DBG7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrpraQ9DBG7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrpraQ9DBG7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrpraQ9DBG7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SrpraQ9DBG7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrpraQ9DBG7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrpraQ9DBG7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SrpraQ9DBG7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrpraQ9DBG7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrpraQ9DBG7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrpraQ9DBG7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrpraQ9DBG7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrpraQ9DBG7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SrpraQ9DBG7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrpraQ9DBG7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrpraQ9DBG7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrpraQ9DBG7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrpraQ9DBG7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrpraQ9DBG7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrpraQ9DBG7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SrpraQ9DBG7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SrpraQ9DBG7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SrpraQ9DBG7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SrpraQ9DBG7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SrpraQ9DBG7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrpraQ9DBG7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrpraQ9DBG7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrpraQ9DBG7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrpraQ9DBG7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SrpraQ9DBG7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrpraQ9DBG7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrpraQ9DBG7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrpraQ9DBG7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrpraQ9DBG7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrpraQ9DBG7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms