Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cyp27a1Q9DBG1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cyp27a1Q9DBG1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cyp27a1Q9DBG1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cyp27a1Q9DBG1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cyp27a1Q9DBG1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cyp27a1Q9DBG1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cyp27a1Q9DBG1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cyp27a1Q9DBG1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cyp27a1Q9DBG1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cyp27a1Q9DBG1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cyp27a1Q9DBG1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cyp27a1Q9DBG1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cyp27a1Q9DBG1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cyp27a1Q9DBG1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cyp27a1Q9DBG1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cyp27a1Q9DBG1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp27a1Q9DBG1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp27a1Q9DBG1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cyp27a1Q9DBG1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cyp27a1Q9DBG1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp27a1Q9DBG1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp27a1Q9DBG1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cyp27a1Q9DBG1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cyp27a1Q9DBG1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cyp27a1Q9DBG1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cyp27a1Q9DBG1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cyp27a1Q9DBG1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cyp27a1Q9DBG1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cyp27a1Q9DBG1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cyp27a1Q9DBG1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cyp27a1Q9DBG1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cyp27a1Q9DBG1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cyp27a1Q9DBG1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cyp27a1Q9DBG1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cyp27a1Q9DBG1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cyp27a1Q9DBG1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cyp27a1Q9DBG1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cyp27a1Q9DBG1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cyp27a1Q9DBG1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cyp27a1Q9DBG1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cyp27a1Q9DBG1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp27a1Q9DBG1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp27a1Q9DBG1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cyp27a1Q9DBG1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cyp27a1Q9DBG1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cyp27a1Q9DBG1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cyp27a1Q9DBG1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cyp27a1Q9DBG1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cyp27a1Q9DBG1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp27a1Q9DBG1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp27a1Q9DBG1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cyp27a1Q9DBG1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms