Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBD2

March8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March8Q9DBD2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
March8Q9DBD2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
March8Q9DBD2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
March8Q9DBD2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
March8Q9DBD2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
March8Q9DBD2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
March8Q9DBD2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
March8Q9DBD2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
March8Q9DBD2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
March8Q9DBD2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
March8Q9DBD2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
March8Q9DBD2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
March8Q9DBD2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
March8Q9DBD2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
March8Q9DBD2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
March8Q9DBD2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
March8Q9DBD2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
March8Q9DBD2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
March8Q9DBD2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
March8Q9DBD2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
March8Q9DBD2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
March8Q9DBD2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
March8Q9DBD2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
March8Q9DBD2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
March8Q9DBD2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
March8Q9DBD2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
March8Q9DBD2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
March8Q9DBD2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
March8Q9DBD2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
March8Q9DBD2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
March8Q9DBD2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
March8Q9DBD2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
March8Q9DBD2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
March8Q9DBD2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
March8Q9DBD2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
March8Q9DBD2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
March8Q9DBD2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
March8Q9DBD2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
March8Q9DBD2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
March8Q9DBD2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
March8Q9DBD2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
March8Q9DBD2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
March8Q9DBD2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
March8Q9DBD2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
March8Q9DBD2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
March8Q9DBD2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
March8Q9DBD2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
March8Q9DBD2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
March8Q9DBD2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
March8Q9DBD2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
March8Q9DBD2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
March8Q9DBD2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
March8Q9DBD2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
March8Q9DBD2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
March8Q9DBD2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
March8Q9DBD2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
March8Q9DBD2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
March8Q9DBD2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
March8Q9DBD2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
March8Q9DBD2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
March8Q9DBD2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
March8Q9DBD2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
March8Q9DBD2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
March8Q9DBD2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
March8Q9DBD2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
March8Q9DBD2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
March8Q9DBD2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
March8Q9DBD2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
March8Q9DBD2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
March8Q9DBD2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
March8Q9DBD2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
March8Q9DBD2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
March8Q9DBD2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
March8Q9DBD2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
March8Q9DBD2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
March8Q9DBD2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
March8Q9DBD2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
March8Q9DBD2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
March8Q9DBD2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
March8Q9DBD2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
March8Q9DBD2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms