Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med27Q9DB40 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med27Q9DB40 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med27Q9DB40 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med27Q9DB40 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med27Q9DB40 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Med27Q9DB40 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Med27Q9DB40 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Med27Q9DB40 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Med27Q9DB40 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med27Q9DB40 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med27Q9DB40 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med27Q9DB40 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med27Q9DB40 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med27Q9DB40 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med27Q9DB40 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med27Q9DB40 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med27Q9DB40 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med27Q9DB40 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med27Q9DB40 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med27Q9DB40 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Med27Q9DB40 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.7 ms