Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAJ8

1700008P02Rik, MCG13911, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700008P02RikQ9DAJ8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700008P02RikQ9DAJ8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700008P02RikQ9DAJ8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700008P02RikQ9DAJ8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms