Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph9Q9D9V4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsph9Q9D9V4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph9Q9D9V4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph9Q9D9V4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph9Q9D9V4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph9Q9D9V4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph9Q9D9V4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph9Q9D9V4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph9Q9D9V4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph9Q9D9V4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph9Q9D9V4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph9Q9D9V4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph9Q9D9V4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph9Q9D9V4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph9Q9D9V4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph9Q9D9V4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph9Q9D9V4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph9Q9D9V4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph9Q9D9V4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph9Q9D9V4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph9Q9D9V4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph9Q9D9V4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph9Q9D9V4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph9Q9D9V4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph9Q9D9V4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph9Q9D9V4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph9Q9D9V4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph9Q9D9V4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph9Q9D9V4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph9Q9D9V4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph9Q9D9V4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph9Q9D9V4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph9Q9D9V4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph9Q9D9V4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph9Q9D9V4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph9Q9D9V4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph9Q9D9V4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph9Q9D9V4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph9Q9D9V4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rsph9Q9D9V4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph9Q9D9V4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph9Q9D9V4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph9Q9D9V4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph9Q9D9V4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph9Q9D9V4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph9Q9D9V4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph9Q9D9V4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph9Q9D9V4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph9Q9D9V4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph9Q9D9V4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph9Q9D9V4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph9Q9D9V4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph9Q9D9V4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph9Q9D9V4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph9Q9D9V4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph9Q9D9V4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph9Q9D9V4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph9Q9D9V4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph9Q9D9V4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph9Q9D9V4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph9Q9D9V4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph9Q9D9V4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph9Q9D9V4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph9Q9D9V4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph9Q9D9V4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph9Q9D9V4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph9Q9D9V4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph9Q9D9V4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph9Q9D9V4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph9Q9D9V4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph9Q9D9V4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph9Q9D9V4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph9Q9D9V4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph9Q9D9V4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph9Q9D9V4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph9Q9D9V4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph9Q9D9V4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph9Q9D9V4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph9Q9D9V4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms