Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calr3Q9D9Q6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calr3Q9D9Q6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calr3Q9D9Q6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calr3Q9D9Q6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calr3Q9D9Q6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calr3Q9D9Q6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Calr3Q9D9Q6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Calr3Q9D9Q6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Calr3Q9D9Q6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Calr3Q9D9Q6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calr3Q9D9Q6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Calr3Q9D9Q6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calr3Q9D9Q6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calr3Q9D9Q6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calr3Q9D9Q6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calr3Q9D9Q6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calr3Q9D9Q6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calr3Q9D9Q6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calr3Q9D9Q6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calr3Q9D9Q6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calr3Q9D9Q6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calr3Q9D9Q6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr3Q9D9Q6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr3Q9D9Q6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr3Q9D9Q6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr3Q9D9Q6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calr3Q9D9Q6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calr3Q9D9Q6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calr3Q9D9Q6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calr3Q9D9Q6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calr3Q9D9Q6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms