Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cnot8Q9D8X5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cnot8Q9D8X5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot8Q9D8X5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot8Q9D8X5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot8Q9D8X5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot8Q9D8X5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot8Q9D8X5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnot8Q9D8X5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot8Q9D8X5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot8Q9D8X5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot8Q9D8X5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot8Q9D8X5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot8Q9D8X5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot8Q9D8X5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot8Q9D8X5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot8Q9D8X5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnot8Q9D8X5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnot8Q9D8X5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnot8Q9D8X5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnot8Q9D8X5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnot8Q9D8X5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnot8Q9D8X5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnot8Q9D8X5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnot8Q9D8X5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnot8Q9D8X5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnot8Q9D8X5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnot8Q9D8X5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnot8Q9D8X5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnot8Q9D8X5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnot8Q9D8X5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnot8Q9D8X5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnot8Q9D8X5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnot8Q9D8X5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cnot8Q9D8X5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cnot8Q9D8X5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnot8Q9D8X5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnot8Q9D8X5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnot8Q9D8X5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnot8Q9D8X5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnot8Q9D8X5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnot8Q9D8X5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnot8Q9D8X5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnot8Q9D8X5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnot8Q9D8X5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnot8Q9D8X5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms