Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fip1l1Q9D824 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fip1l1Q9D824 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fip1l1Q9D824 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fip1l1Q9D824 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fip1l1Q9D824 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fip1l1Q9D824 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fip1l1Q9D824 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fip1l1Q9D824 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fip1l1Q9D824 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fip1l1Q9D824 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fip1l1Q9D824 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fip1l1Q9D824 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fip1l1Q9D824 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fip1l1Q9D824 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fip1l1Q9D824 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fip1l1Q9D824 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fip1l1Q9D824 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fip1l1Q9D824 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fip1l1Q9D824 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fip1l1Q9D824 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fip1l1Q9D824 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fip1l1Q9D824 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fip1l1Q9D824 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fip1l1Q9D824 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fip1l1Q9D824 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fip1l1Q9D824 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fip1l1Q9D824 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fip1l1Q9D824 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fip1l1Q9D824 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fip1l1Q9D824 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fip1l1Q9D824 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fip1l1Q9D824 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms