Protein–RNA interactions for Protein: Q9D809

2200002D01Rik, MCG22941, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2200002D01RikQ9D809 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2200002D01RikQ9D809 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
2200002D01RikQ9D809 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2200002D01RikQ9D809 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
2200002D01RikQ9D809 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
2200002D01RikQ9D809 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms