Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capn9Q9D805 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capn9Q9D805 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capn9Q9D805 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Capn9Q9D805 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Capn9Q9D805 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Capn9Q9D805 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Capn9Q9D805 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Capn9Q9D805 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Capn9Q9D805 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Capn9Q9D805 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capn9Q9D805 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capn9Q9D805 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capn9Q9D805 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Capn9Q9D805 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capn9Q9D805 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capn9Q9D805 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capn9Q9D805 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Capn9Q9D805 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Capn9Q9D805 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Capn9Q9D805 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Capn9Q9D805 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Capn9Q9D805 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Capn9Q9D805 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Capn9Q9D805 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Capn9Q9D805 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Capn9Q9D805 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Capn9Q9D805 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Capn9Q9D805 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Capn9Q9D805 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Capn9Q9D805 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Capn9Q9D805 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capn9Q9D805 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capn9Q9D805 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capn9Q9D805 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capn9Q9D805 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Capn9Q9D805 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Capn9Q9D805 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Capn9Q9D805 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Capn9Q9D805 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Capn9Q9D805 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Capn9Q9D805 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Capn9Q9D805 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Capn9Q9D805 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Capn9Q9D805 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Capn9Q9D805 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Capn9Q9D805 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Capn9Q9D805 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Capn9Q9D805 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Capn9Q9D805 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Capn9Q9D805 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Capn9Q9D805 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Capn9Q9D805 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Capn9Q9D805 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capn9Q9D805 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capn9Q9D805 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capn9Q9D805 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capn9Q9D805 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms