Protein–RNA interactions for Protein: Q9D709

Tmem79, Transmembrane protein 79, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem79Q9D709 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmem79Q9D709 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmem79Q9D709 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmem79Q9D709 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmem79Q9D709 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmem79Q9D709 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmem79Q9D709 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmem79Q9D709 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmem79Q9D709 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmem79Q9D709 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmem79Q9D709 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmem79Q9D709 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmem79Q9D709 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmem79Q9D709 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmem79Q9D709 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmem79Q9D709 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmem79Q9D709 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmem79Q9D709 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmem79Q9D709 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmem79Q9D709 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmem79Q9D709 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmem79Q9D709 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmem79Q9D709 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmem79Q9D709 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmem79Q9D709 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmem79Q9D709 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmem79Q9D709 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmem79Q9D709 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmem79Q9D709 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmem79Q9D709 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmem79Q9D709 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmem79Q9D709 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmem79Q9D709 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmem79Q9D709 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmem79Q9D709 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmem79Q9D709 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmem79Q9D709 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmem79Q9D709 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmem79Q9D709 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmem79Q9D709 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmem79Q9D709 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmem79Q9D709 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmem79Q9D709 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmem79Q9D709 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmem79Q9D709 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmem79Q9D709 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmem79Q9D709 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmem79Q9D709 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tmem79Q9D709 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmem79Q9D709 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmem79Q9D709 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmem79Q9D709 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmem79Q9D709 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmem79Q9D709 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmem79Q9D709 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmem79Q9D709 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmem79Q9D709 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmem79Q9D709 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmem79Q9D709 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmem79Q9D709 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmem79Q9D709 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmem79Q9D709 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmem79Q9D709 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmem79Q9D709 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tmem79Q9D709 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tmem79Q9D709 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmem79Q9D709 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmem79Q9D709 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmem79Q9D709 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmem79Q9D709 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmem79Q9D709 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmem79Q9D709 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmem79Q9D709 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmem79Q9D709 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmem79Q9D709 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmem79Q9D709 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmem79Q9D709 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmem79Q9D709 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmem79Q9D709 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmem79Q9D709 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmem79Q9D709 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmem79Q9D709 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmem79Q9D709 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmem79Q9D709 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmem79Q9D709 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmem79Q9D709 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmem79Q9D709 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmem79Q9D709 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmem79Q9D709 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmem79Q9D709 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmem79Q9D709 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmem79Q9D709 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmem79Q9D709 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmem79Q9D709 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmem79Q9D709 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmem79Q9D709 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmem79Q9D709 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmem79Q9D709 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmem79Q9D709 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmem79Q9D709 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms