Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubb4aQ9D6F9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tubb4aQ9D6F9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tubb4aQ9D6F9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubb4aQ9D6F9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubb4aQ9D6F9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubb4aQ9D6F9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubb4aQ9D6F9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubb4aQ9D6F9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubb4aQ9D6F9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubb4aQ9D6F9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubb4aQ9D6F9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubb4aQ9D6F9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubb4aQ9D6F9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubb4aQ9D6F9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubb4aQ9D6F9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubb4aQ9D6F9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubb4aQ9D6F9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubb4aQ9D6F9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubb4aQ9D6F9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubb4aQ9D6F9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubb4aQ9D6F9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubb4aQ9D6F9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubb4aQ9D6F9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubb4aQ9D6F9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubb4aQ9D6F9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubb4aQ9D6F9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubb4aQ9D6F9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubb4aQ9D6F9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubb4aQ9D6F9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubb4aQ9D6F9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubb4aQ9D6F9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubb4aQ9D6F9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubb4aQ9D6F9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tubb4aQ9D6F9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubb4aQ9D6F9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubb4aQ9D6F9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubb4aQ9D6F9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubb4aQ9D6F9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubb4aQ9D6F9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubb4aQ9D6F9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubb4aQ9D6F9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubb4aQ9D6F9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubb4aQ9D6F9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubb4aQ9D6F9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubb4aQ9D6F9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubb4aQ9D6F9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubb4aQ9D6F9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tubb4aQ9D6F9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubb4aQ9D6F9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms