Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6B9

Hrct1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrct1Q9D6B9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hrct1Q9D6B9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hrct1Q9D6B9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hrct1Q9D6B9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms