Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gins2Q9D600 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gins2Q9D600 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gins2Q9D600 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gins2Q9D600 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gins2Q9D600 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gins2Q9D600 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gins2Q9D600 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gins2Q9D600 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gins2Q9D600 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gins2Q9D600 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gins2Q9D600 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gins2Q9D600 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gins2Q9D600 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gins2Q9D600 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gins2Q9D600 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gins2Q9D600 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gins2Q9D600 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gins2Q9D600 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gins2Q9D600 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gins2Q9D600 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gins2Q9D600 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gins2Q9D600 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gins2Q9D600 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gins2Q9D600 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gins2Q9D600 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gins2Q9D600 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gins2Q9D600 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gins2Q9D600 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gins2Q9D600 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gins2Q9D600 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gins2Q9D600 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gins2Q9D600 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gins2Q9D600 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gins2Q9D600 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gins2Q9D600 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gins2Q9D600 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gins2Q9D600 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gins2Q9D600 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gins2Q9D600 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gins2Q9D600 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gins2Q9D600 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gins2Q9D600 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gins2Q9D600 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gins2Q9D600 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gins2Q9D600 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gins2Q9D600 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gins2Q9D600 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gins2Q9D600 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gins2Q9D600 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gins2Q9D600 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gins2Q9D600 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gins2Q9D600 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gins2Q9D600 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gins2Q9D600 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gins2Q9D600 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gins2Q9D600 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gins2Q9D600 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gins2Q9D600 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gins2Q9D600 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gins2Q9D600 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gins2Q9D600 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gins2Q9D600 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gins2Q9D600 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gins2Q9D600 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gins2Q9D600 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gins2Q9D600 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gins2Q9D600 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gins2Q9D600 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gins2Q9D600 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gins2Q9D600 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gins2Q9D600 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gins2Q9D600 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gins2Q9D600 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gins2Q9D600 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gins2Q9D600 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gins2Q9D600 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gins2Q9D600 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gins2Q9D600 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gins2Q9D600 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gins2Q9D600 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gins2Q9D600 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms