Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc7Q9D541 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc7Q9D541 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc7Q9D541 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc7Q9D541 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc7Q9D541 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc7Q9D541 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc7Q9D541 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc7Q9D541 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc7Q9D541 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc7Q9D541 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc7Q9D541 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc7Q9D541 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc7Q9D541 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc7Q9D541 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc7Q9D541 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc7Q9D541 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc7Q9D541 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc7Q9D541 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc7Q9D541 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc7Q9D541 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc7Q9D541 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc7Q9D541 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc7Q9D541 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc7Q9D541 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc7Q9D541 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc7Q9D541 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc7Q9D541 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc7Q9D541 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc7Q9D541 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc7Q9D541 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc7Q9D541 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc7Q9D541 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc7Q9D541 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc7Q9D541 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc7Q9D541 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc7Q9D541 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc7Q9D541 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc7Q9D541 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc7Q9D541 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc7Q9D541 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc7Q9D541 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc7Q9D541 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc7Q9D541 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc7Q9D541 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc7Q9D541 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc7Q9D541 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc7Q9D541 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc7Q9D541 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc7Q9D541 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc7Q9D541 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc7Q9D541 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc7Q9D541 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc7Q9D541 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc7Q9D541 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc7Q9D541 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc7Q9D541 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms