Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rabl3Q9D4V7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rabl3Q9D4V7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rabl3Q9D4V7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rabl3Q9D4V7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rabl3Q9D4V7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rabl3Q9D4V7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rabl3Q9D4V7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rabl3Q9D4V7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rabl3Q9D4V7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rabl3Q9D4V7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rabl3Q9D4V7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rabl3Q9D4V7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rabl3Q9D4V7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rabl3Q9D4V7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rabl3Q9D4V7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rabl3Q9D4V7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rabl3Q9D4V7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rabl3Q9D4V7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rabl3Q9D4V7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rabl3Q9D4V7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rabl3Q9D4V7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rabl3Q9D4V7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rabl3Q9D4V7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rabl3Q9D4V7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rabl3Q9D4V7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rabl3Q9D4V7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rabl3Q9D4V7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rabl3Q9D4V7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rabl3Q9D4V7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rabl3Q9D4V7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rabl3Q9D4V7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rabl3Q9D4V7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rabl3Q9D4V7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rabl3Q9D4V7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rabl3Q9D4V7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rabl3Q9D4V7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rabl3Q9D4V7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rabl3Q9D4V7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rabl3Q9D4V7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rabl3Q9D4V7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rabl3Q9D4V7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rabl3Q9D4V7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rabl3Q9D4V7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rabl3Q9D4V7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rabl3Q9D4V7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rabl3Q9D4V7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rabl3Q9D4V7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rabl3Q9D4V7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rabl3Q9D4V7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rabl3Q9D4V7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rabl3Q9D4V7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rabl3Q9D4V7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rabl3Q9D4V7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms