Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gcc1Q9D4H2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gcc1Q9D4H2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gcc1Q9D4H2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gcc1Q9D4H2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gcc1Q9D4H2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gcc1Q9D4H2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gcc1Q9D4H2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gcc1Q9D4H2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gcc1Q9D4H2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gcc1Q9D4H2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gcc1Q9D4H2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gcc1Q9D4H2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gcc1Q9D4H2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gcc1Q9D4H2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Gcc1Q9D4H2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gcc1Q9D4H2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Gcc1Q9D4H2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gcc1Q9D4H2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gcc1Q9D4H2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gcc1Q9D4H2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gcc1Q9D4H2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gcc1Q9D4H2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gcc1Q9D4H2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gcc1Q9D4H2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gcc1Q9D4H2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gcc1Q9D4H2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gcc1Q9D4H2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gcc1Q9D4H2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gcc1Q9D4H2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gcc1Q9D4H2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gcc1Q9D4H2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gcc1Q9D4H2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gcc1Q9D4H2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Gcc1Q9D4H2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gcc1Q9D4H2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Gcc1Q9D4H2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Gcc1Q9D4H2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gcc1Q9D4H2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gcc1Q9D4H2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gcc1Q9D4H2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Gcc1Q9D4H2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gcc1Q9D4H2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gcc1Q9D4H2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gcc1Q9D4H2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Gcc1Q9D4H2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gcc1Q9D4H2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gcc1Q9D4H2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gcc1Q9D4H2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gcc1Q9D4H2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gcc1Q9D4H2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gcc1Q9D4H2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gcc1Q9D4H2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gcc1Q9D4H2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gcc1Q9D4H2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gcc1Q9D4H2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gcc1Q9D4H2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gcc1Q9D4H2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gcc1Q9D4H2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gcc1Q9D4H2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gcc1Q9D4H2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gcc1Q9D4H2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gcc1Q9D4H2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gcc1Q9D4H2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Gcc1Q9D4H2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Gcc1Q9D4H2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gcc1Q9D4H2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gcc1Q9D4H2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gcc1Q9D4H2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gcc1Q9D4H2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gcc1Q9D4H2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gcc1Q9D4H2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gcc1Q9D4H2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gcc1Q9D4H2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gcc1Q9D4H2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gcc1Q9D4H2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gcc1Q9D4H2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gcc1Q9D4H2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gcc1Q9D4H2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gcc1Q9D4H2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gcc1Q9D4H2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gcc1Q9D4H2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gcc1Q9D4H2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gcc1Q9D4H2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gcc1Q9D4H2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gcc1Q9D4H2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Gcc1Q9D4H2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gcc1Q9D4H2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gcc1Q9D4H2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gcc1Q9D4H2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gcc1Q9D4H2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gcc1Q9D4H2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gcc1Q9D4H2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gcc1Q9D4H2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms