Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
4933402E13RikQ9D4D2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
4933402E13RikQ9D4D2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
4933402E13RikQ9D4D2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
4933402E13RikQ9D4D2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
4933402E13RikQ9D4D2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
4933402E13RikQ9D4D2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
4933402E13RikQ9D4D2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
4933402E13RikQ9D4D2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4933402E13RikQ9D4D2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
4933402E13RikQ9D4D2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
4933402E13RikQ9D4D2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
4933402E13RikQ9D4D2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
4933402E13RikQ9D4D2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
4933402E13RikQ9D4D2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4933402E13RikQ9D4D2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
4933402E13RikQ9D4D2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4933402E13RikQ9D4D2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4933402E13RikQ9D4D2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
4933402E13RikQ9D4D2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
4933402E13RikQ9D4D2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4933402E13RikQ9D4D2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4933402E13RikQ9D4D2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
4933402E13RikQ9D4D2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
4933402E13RikQ9D4D2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4933402E13RikQ9D4D2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4933402E13RikQ9D4D2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
4933402E13RikQ9D4D2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4933402E13RikQ9D4D2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
4933402E13RikQ9D4D2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4933402E13RikQ9D4D2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4933402E13RikQ9D4D2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4933402E13RikQ9D4D2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4933402E13RikQ9D4D2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
4933402E13RikQ9D4D2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
4933402E13RikQ9D4D2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
4933402E13RikQ9D4D2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
4933402E13RikQ9D4D2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
4933402E13RikQ9D4D2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
4933402E13RikQ9D4D2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
4933402E13RikQ9D4D2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
4933402E13RikQ9D4D2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4933402E13RikQ9D4D2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
4933402E13RikQ9D4D2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
4933402E13RikQ9D4D2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
4933402E13RikQ9D4D2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4933402E13RikQ9D4D2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
4933402E13RikQ9D4D2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4933402E13RikQ9D4D2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4933402E13RikQ9D4D2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4933402E13RikQ9D4D2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
4933402E13RikQ9D4D2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
4933402E13RikQ9D4D2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms