Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Clvs1Q9D4C9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clvs1Q9D4C9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clvs1Q9D4C9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clvs1Q9D4C9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clvs1Q9D4C9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clvs1Q9D4C9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clvs1Q9D4C9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clvs1Q9D4C9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clvs1Q9D4C9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clvs1Q9D4C9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clvs1Q9D4C9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clvs1Q9D4C9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clvs1Q9D4C9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clvs1Q9D4C9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Clvs1Q9D4C9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clvs1Q9D4C9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms