Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933428M09RikQ9D3X3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933428M09RikQ9D3X3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933428M09RikQ9D3X3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms