Protein–RNA interactions for Protein: Q9D328

Tmem35a, Transmembrane protein 35A, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35aQ9D328 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem35aQ9D328 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem35aQ9D328 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem35aQ9D328 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem35aQ9D328 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem35aQ9D328 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem35aQ9D328 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem35aQ9D328 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem35aQ9D328 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem35aQ9D328 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem35aQ9D328 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem35aQ9D328 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem35aQ9D328 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem35aQ9D328 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem35aQ9D328 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem35aQ9D328 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem35aQ9D328 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem35aQ9D328 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem35aQ9D328 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem35aQ9D328 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem35aQ9D328 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem35aQ9D328 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem35aQ9D328 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem35aQ9D328 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem35aQ9D328 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem35aQ9D328 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem35aQ9D328 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem35aQ9D328 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem35aQ9D328 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem35aQ9D328 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem35aQ9D328 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem35aQ9D328 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem35aQ9D328 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem35aQ9D328 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem35aQ9D328 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem35aQ9D328 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem35aQ9D328 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem35aQ9D328 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms