Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H9

Dnaaf1, Dynein assembly factor 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf1Q9D2H9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnaaf1Q9D2H9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnaaf1Q9D2H9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnaaf1Q9D2H9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnaaf1Q9D2H9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnaaf1Q9D2H9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnaaf1Q9D2H9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnaaf1Q9D2H9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnaaf1Q9D2H9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnaaf1Q9D2H9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnaaf1Q9D2H9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnaaf1Q9D2H9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnaaf1Q9D2H9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnaaf1Q9D2H9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnaaf1Q9D2H9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnaaf1Q9D2H9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnaaf1Q9D2H9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnaaf1Q9D2H9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnaaf1Q9D2H9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnaaf1Q9D2H9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnaaf1Q9D2H9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnaaf1Q9D2H9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnaaf1Q9D2H9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnaaf1Q9D2H9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnaaf1Q9D2H9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnaaf1Q9D2H9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnaaf1Q9D2H9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnaaf1Q9D2H9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnaaf1Q9D2H9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnaaf1Q9D2H9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnaaf1Q9D2H9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnaaf1Q9D2H9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnaaf1Q9D2H9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnaaf1Q9D2H9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnaaf1Q9D2H9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnaaf1Q9D2H9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnaaf1Q9D2H9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnaaf1Q9D2H9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnaaf1Q9D2H9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnaaf1Q9D2H9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnaaf1Q9D2H9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnaaf1Q9D2H9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnaaf1Q9D2H9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnaaf1Q9D2H9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnaaf1Q9D2H9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnaaf1Q9D2H9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnaaf1Q9D2H9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnaaf1Q9D2H9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnaaf1Q9D2H9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnaaf1Q9D2H9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms