Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pramef12Q9D2F1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pramef12Q9D2F1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pramef12Q9D2F1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pramef12Q9D2F1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pramef12Q9D2F1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pramef12Q9D2F1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pramef12Q9D2F1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pramef12Q9D2F1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pramef12Q9D2F1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pramef12Q9D2F1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pramef12Q9D2F1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pramef12Q9D2F1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pramef12Q9D2F1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pramef12Q9D2F1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pramef12Q9D2F1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pramef12Q9D2F1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pramef12Q9D2F1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215 ms