Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Krtap5-3Q9D226 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Krtap5-3Q9D226 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Krtap5-3Q9D226 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krtap5-3Q9D226 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krtap5-3Q9D226 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krtap5-3Q9D226 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Krtap5-3Q9D226 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krtap5-3Q9D226 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krtap5-3Q9D226 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Krtap5-3Q9D226 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Krtap5-3Q9D226 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krtap5-3Q9D226 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krtap5-3Q9D226 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krtap5-3Q9D226 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krtap5-3Q9D226 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krtap5-3Q9D226 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krtap5-3Q9D226 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krtap5-3Q9D226 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krtap5-3Q9D226 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krtap5-3Q9D226 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krtap5-3Q9D226 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krtap5-3Q9D226 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Krtap5-3Q9D226 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Krtap5-3Q9D226 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krtap5-3Q9D226 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krtap5-3Q9D226 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krtap5-3Q9D226 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Krtap5-3Q9D226 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Krtap5-3Q9D226 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Krtap5-3Q9D226 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Krtap5-3Q9D226 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Krtap5-3Q9D226 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Krtap5-3Q9D226 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Krtap5-3Q9D226 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Krtap5-3Q9D226 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Krtap5-3Q9D226 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Krtap5-3Q9D226 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Krtap5-3Q9D226 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Krtap5-3Q9D226 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krtap5-3Q9D226 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Krtap5-3Q9D226 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Krtap5-3Q9D226 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krtap5-3Q9D226 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krtap5-3Q9D226 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Krtap5-3Q9D226 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Krtap5-3Q9D226 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krtap5-3Q9D226 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krtap5-3Q9D226 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Krtap5-3Q9D226 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krtap5-3Q9D226 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krtap5-3Q9D226 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krtap5-3Q9D226 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Krtap5-3Q9D226 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krtap5-3Q9D226 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krtap5-3Q9D226 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krtap5-3Q9D226 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krtap5-3Q9D226 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Krtap5-3Q9D226 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Krtap5-3Q9D226 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krtap5-3Q9D226 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krtap5-3Q9D226 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krtap5-3Q9D226 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krtap5-3Q9D226 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krtap5-3Q9D226 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krtap5-3Q9D226 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Krtap5-3Q9D226 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krtap5-3Q9D226 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krtap5-3Q9D226 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krtap5-3Q9D226 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krtap5-3Q9D226 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krtap5-3Q9D226 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms