Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm1Q9D103 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifitm1Q9D103 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifitm1Q9D103 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifitm1Q9D103 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms