Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpsap1Q9D0M1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpsap1Q9D0M1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpsap1Q9D0M1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpsap1Q9D0M1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpsap1Q9D0M1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpsap1Q9D0M1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpsap1Q9D0M1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpsap1Q9D0M1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpsap1Q9D0M1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prpsap1Q9D0M1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpsap1Q9D0M1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpsap1Q9D0M1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpsap1Q9D0M1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpsap1Q9D0M1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpsap1Q9D0M1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpsap1Q9D0M1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpsap1Q9D0M1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpsap1Q9D0M1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpsap1Q9D0M1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpsap1Q9D0M1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpsap1Q9D0M1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpsap1Q9D0M1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpsap1Q9D0M1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpsap1Q9D0M1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpsap1Q9D0M1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpsap1Q9D0M1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpsap1Q9D0M1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpsap1Q9D0M1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prpsap1Q9D0M1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpsap1Q9D0M1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpsap1Q9D0M1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpsap1Q9D0M1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpsap1Q9D0M1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpsap1Q9D0M1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpsap1Q9D0M1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpsap1Q9D0M1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpsap1Q9D0M1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpsap1Q9D0M1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpsap1Q9D0M1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpsap1Q9D0M1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpsap1Q9D0M1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpsap1Q9D0M1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpsap1Q9D0M1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpsap1Q9D0M1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpsap1Q9D0M1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpsap1Q9D0M1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpsap1Q9D0M1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpsap1Q9D0M1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpsap1Q9D0M1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpsap1Q9D0M1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpsap1Q9D0M1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpsap1Q9D0M1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpsap1Q9D0M1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpsap1Q9D0M1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpsap1Q9D0M1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpsap1Q9D0M1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpsap1Q9D0M1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpsap1Q9D0M1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpsap1Q9D0M1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpsap1Q9D0M1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpsap1Q9D0M1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpsap1Q9D0M1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpsap1Q9D0M1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpsap1Q9D0M1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpsap1Q9D0M1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpsap1Q9D0M1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms