Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mms19Q9D071 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mms19Q9D071 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mms19Q9D071 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mms19Q9D071 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mms19Q9D071 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mms19Q9D071 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mms19Q9D071 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mms19Q9D071 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mms19Q9D071 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mms19Q9D071 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mms19Q9D071 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mms19Q9D071 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mms19Q9D071 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Mms19Q9D071 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mms19Q9D071 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mms19Q9D071 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mms19Q9D071 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mms19Q9D071 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mms19Q9D071 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mms19Q9D071 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mms19Q9D071 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mms19Q9D071 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mms19Q9D071 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mms19Q9D071 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mms19Q9D071 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Mms19Q9D071 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mms19Q9D071 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mms19Q9D071 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mms19Q9D071 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mms19Q9D071 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Mms19Q9D071 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mms19Q9D071 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mms19Q9D071 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mms19Q9D071 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mms19Q9D071 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mms19Q9D071 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mms19Q9D071 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mms19Q9D071 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mms19Q9D071 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mms19Q9D071 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mms19Q9D071 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mms19Q9D071 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mms19Q9D071 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mms19Q9D071 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mms19Q9D071 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mms19Q9D071 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mms19Q9D071 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mms19Q9D071 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mms19Q9D071 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mms19Q9D071 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mms19Q9D071 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mms19Q9D071 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mms19Q9D071 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mms19Q9D071 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mms19Q9D071 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mms19Q9D071 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mms19Q9D071 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mms19Q9D071 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mms19Q9D071 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mms19Q9D071 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mms19Q9D071 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms