Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shmt2Q9CZN7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shmt2Q9CZN7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shmt2Q9CZN7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shmt2Q9CZN7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shmt2Q9CZN7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shmt2Q9CZN7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shmt2Q9CZN7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shmt2Q9CZN7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shmt2Q9CZN7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shmt2Q9CZN7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Shmt2Q9CZN7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shmt2Q9CZN7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shmt2Q9CZN7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Shmt2Q9CZN7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Shmt2Q9CZN7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shmt2Q9CZN7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shmt2Q9CZN7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shmt2Q9CZN7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shmt2Q9CZN7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shmt2Q9CZN7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shmt2Q9CZN7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shmt2Q9CZN7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shmt2Q9CZN7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Shmt2Q9CZN7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shmt2Q9CZN7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shmt2Q9CZN7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shmt2Q9CZN7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shmt2Q9CZN7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shmt2Q9CZN7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Shmt2Q9CZN7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shmt2Q9CZN7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shmt2Q9CZN7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Shmt2Q9CZN7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shmt2Q9CZN7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shmt2Q9CZN7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shmt2Q9CZN7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Shmt2Q9CZN7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shmt2Q9CZN7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shmt2Q9CZN7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shmt2Q9CZN7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shmt2Q9CZN7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shmt2Q9CZN7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shmt2Q9CZN7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shmt2Q9CZN7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shmt2Q9CZN7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shmt2Q9CZN7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shmt2Q9CZN7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shmt2Q9CZN7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shmt2Q9CZN7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.7 ms