Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdhd3Q9CYW4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdhd3Q9CYW4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms