Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY50

Ssr1, Translocon-associated protein subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr1Q9CY50 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssr1Q9CY50 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssr1Q9CY50 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssr1Q9CY50 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssr1Q9CY50 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssr1Q9CY50 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssr1Q9CY50 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssr1Q9CY50 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssr1Q9CY50 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssr1Q9CY50 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ssr1Q9CY50 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssr1Q9CY50 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssr1Q9CY50 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssr1Q9CY50 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssr1Q9CY50 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssr1Q9CY50 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssr1Q9CY50 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssr1Q9CY50 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssr1Q9CY50 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssr1Q9CY50 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssr1Q9CY50 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssr1Q9CY50 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssr1Q9CY50 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssr1Q9CY50 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssr1Q9CY50 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ssr1Q9CY50 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ssr1Q9CY50 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssr1Q9CY50 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ssr1Q9CY50 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssr1Q9CY50 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssr1Q9CY50 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssr1Q9CY50 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssr1Q9CY50 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssr1Q9CY50 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssr1Q9CY50 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssr1Q9CY50 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssr1Q9CY50 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssr1Q9CY50 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssr1Q9CY50 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssr1Q9CY50 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssr1Q9CY50 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssr1Q9CY50 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssr1Q9CY50 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ssr1Q9CY50 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssr1Q9CY50 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssr1Q9CY50 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssr1Q9CY50 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssr1Q9CY50 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssr1Q9CY50 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssr1Q9CY50 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssr1Q9CY50 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssr1Q9CY50 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms