Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm5Q9CXE0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm5Q9CXE0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm5Q9CXE0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm5Q9CXE0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm5Q9CXE0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm5Q9CXE0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm5Q9CXE0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm5Q9CXE0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm5Q9CXE0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm5Q9CXE0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm5Q9CXE0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm5Q9CXE0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm5Q9CXE0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm5Q9CXE0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm5Q9CXE0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm5Q9CXE0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm5Q9CXE0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm5Q9CXE0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm5Q9CXE0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm5Q9CXE0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm5Q9CXE0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm5Q9CXE0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm5Q9CXE0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm5Q9CXE0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm5Q9CXE0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm5Q9CXE0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm5Q9CXE0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm5Q9CXE0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm5Q9CXE0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm5Q9CXE0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm5Q9CXE0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm5Q9CXE0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm5Q9CXE0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm5Q9CXE0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm5Q9CXE0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm5Q9CXE0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm5Q9CXE0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm5Q9CXE0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm5Q9CXE0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm5Q9CXE0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm5Q9CXE0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm5Q9CXE0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm5Q9CXE0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm5Q9CXE0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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