Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sugt1Q9CX34 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sugt1Q9CX34 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sugt1Q9CX34 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sugt1Q9CX34 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sugt1Q9CX34 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sugt1Q9CX34 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sugt1Q9CX34 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sugt1Q9CX34 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sugt1Q9CX34 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sugt1Q9CX34 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sugt1Q9CX34 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sugt1Q9CX34 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sugt1Q9CX34 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sugt1Q9CX34 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sugt1Q9CX34 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sugt1Q9CX34 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sugt1Q9CX34 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sugt1Q9CX34 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sugt1Q9CX34 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sugt1Q9CX34 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sugt1Q9CX34 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sugt1Q9CX34 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sugt1Q9CX34 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sugt1Q9CX34 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sugt1Q9CX34 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sugt1Q9CX34 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sugt1Q9CX34 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sugt1Q9CX34 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sugt1Q9CX34 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms