Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW46

Raver1, Ribonucleoprotein PTB-binding 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver1Q9CW46 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Raver1Q9CW46 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Raver1Q9CW46 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Raver1Q9CW46 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Raver1Q9CW46 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Raver1Q9CW46 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Raver1Q9CW46 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Raver1Q9CW46 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Raver1Q9CW46 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Raver1Q9CW46 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Raver1Q9CW46 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Raver1Q9CW46 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Raver1Q9CW46 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Raver1Q9CW46 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Raver1Q9CW46 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Raver1Q9CW46 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Raver1Q9CW46 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Raver1Q9CW46 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Raver1Q9CW46 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Raver1Q9CW46 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Raver1Q9CW46 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Raver1Q9CW46 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Raver1Q9CW46 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Raver1Q9CW46 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Raver1Q9CW46 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Raver1Q9CW46 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Raver1Q9CW46 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Raver1Q9CW46 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Raver1Q9CW46 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Raver1Q9CW46 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Raver1Q9CW46 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Raver1Q9CW46 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Raver1Q9CW46 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Raver1Q9CW46 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Raver1Q9CW46 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Raver1Q9CW46 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Raver1Q9CW46 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Raver1Q9CW46 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Raver1Q9CW46 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Raver1Q9CW46 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Raver1Q9CW46 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Raver1Q9CW46 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Raver1Q9CW46 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Raver1Q9CW46 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Raver1Q9CW46 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Raver1Q9CW46 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Raver1Q9CW46 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Raver1Q9CW46 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Raver1Q9CW46 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Raver1Q9CW46 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Raver1Q9CW46 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Raver1Q9CW46 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Raver1Q9CW46 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Raver1Q9CW46 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Raver1Q9CW46 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Raver1Q9CW46 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Raver1Q9CW46 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Raver1Q9CW46 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Raver1Q9CW46 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Raver1Q9CW46 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Raver1Q9CW46 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Raver1Q9CW46 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Raver1Q9CW46 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Raver1Q9CW46 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Raver1Q9CW46 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Raver1Q9CW46 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Raver1Q9CW46 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Raver1Q9CW46 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Raver1Q9CW46 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Raver1Q9CW46 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Raver1Q9CW46 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Raver1Q9CW46 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Raver1Q9CW46 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Raver1Q9CW46 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Raver1Q9CW46 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Raver1Q9CW46 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Raver1Q9CW46 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Raver1Q9CW46 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Raver1Q9CW46 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Raver1Q9CW46 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Raver1Q9CW46 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms