Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4930524J08RikQ9CUJ5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms