Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smc1aQ9CU62 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Smc1aQ9CU62 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smc1aQ9CU62 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smc1aQ9CU62 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smc1aQ9CU62 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smc1aQ9CU62 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smc1aQ9CU62 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smc1aQ9CU62 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smc1aQ9CU62 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smc1aQ9CU62 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smc1aQ9CU62 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smc1aQ9CU62 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smc1aQ9CU62 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smc1aQ9CU62 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smc1aQ9CU62 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smc1aQ9CU62 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smc1aQ9CU62 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smc1aQ9CU62 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smc1aQ9CU62 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smc1aQ9CU62 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smc1aQ9CU62 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smc1aQ9CU62 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smc1aQ9CU62 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smc1aQ9CU62 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smc1aQ9CU62 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smc1aQ9CU62 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smc1aQ9CU62 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smc1aQ9CU62 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smc1aQ9CU62 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smc1aQ9CU62 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smc1aQ9CU62 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smc1aQ9CU62 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smc1aQ9CU62 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smc1aQ9CU62 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smc1aQ9CU62 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smc1aQ9CU62 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smc1aQ9CU62 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smc1aQ9CU62 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smc1aQ9CU62 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smc1aQ9CU62 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smc1aQ9CU62 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smc1aQ9CU62 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smc1aQ9CU62 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smc1aQ9CU62 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smc1aQ9CU62 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smc1aQ9CU62 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smc1aQ9CU62 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smc1aQ9CU62 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smc1aQ9CU62 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smc1aQ9CU62 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smc1aQ9CU62 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smc1aQ9CU62 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smc1aQ9CU62 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smc1aQ9CU62 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Smc1aQ9CU62 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms