Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700029F12RikQ9CRB4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700029F12RikQ9CRB4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
1700029F12RikQ9CRB4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms