Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc96Q9CR92 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc96Q9CR92 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc96Q9CR92 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc96Q9CR92 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc96Q9CR92 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc96Q9CR92 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc96Q9CR92 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc96Q9CR92 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc96Q9CR92 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc96Q9CR92 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc96Q9CR92 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc96Q9CR92 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc96Q9CR92 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc96Q9CR92 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc96Q9CR92 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc96Q9CR92 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc96Q9CR92 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc96Q9CR92 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc96Q9CR92 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc96Q9CR92 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc96Q9CR92 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc96Q9CR92 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc96Q9CR92 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc96Q9CR92 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc96Q9CR92 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc96Q9CR92 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc96Q9CR92 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc96Q9CR92 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc96Q9CR92 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc96Q9CR92 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc96Q9CR92 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc96Q9CR92 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc96Q9CR92 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc96Q9CR92 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc96Q9CR92 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc96Q9CR92 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc96Q9CR92 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc96Q9CR92 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc96Q9CR92 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc96Q9CR92 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc96Q9CR92 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc96Q9CR92 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc96Q9CR92 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc96Q9CR92 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc96Q9CR92 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc96Q9CR92 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc96Q9CR92 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc96Q9CR92 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc96Q9CR92 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc96Q9CR92 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc96Q9CR92 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc96Q9CR92 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc96Q9CR92 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc96Q9CR92 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc96Q9CR92 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc96Q9CR92 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc96Q9CR92 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc96Q9CR92 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc96Q9CR92 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc96Q9CR92 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc96Q9CR92 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms