Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ankrd1Q9CR42 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ankrd1Q9CR42 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ankrd1Q9CR42 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ankrd1Q9CR42 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ankrd1Q9CR42 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ankrd1Q9CR42 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ankrd1Q9CR42 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ankrd1Q9CR42 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ankrd1Q9CR42 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ankrd1Q9CR42 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ankrd1Q9CR42 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ankrd1Q9CR42 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ankrd1Q9CR42 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ankrd1Q9CR42 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ankrd1Q9CR42 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ankrd1Q9CR42 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ankrd1Q9CR42 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ankrd1Q9CR42 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ankrd1Q9CR42 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ankrd1Q9CR42 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ankrd1Q9CR42 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ankrd1Q9CR42 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ankrd1Q9CR42 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ankrd1Q9CR42 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ankrd1Q9CR42 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ankrd1Q9CR42 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ankrd1Q9CR42 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ankrd1Q9CR42 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ankrd1Q9CR42 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ankrd1Q9CR42 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ankrd1Q9CR42 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ankrd1Q9CR42 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ankrd1Q9CR42 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ankrd1Q9CR42 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ankrd1Q9CR42 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ankrd1Q9CR42 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ankrd1Q9CR42 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms