Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ykt6Q9CQW1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ykt6Q9CQW1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ykt6Q9CQW1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ykt6Q9CQW1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ykt6Q9CQW1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ykt6Q9CQW1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ykt6Q9CQW1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ykt6Q9CQW1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ykt6Q9CQW1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ykt6Q9CQW1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ykt6Q9CQW1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ykt6Q9CQW1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ykt6Q9CQW1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ykt6Q9CQW1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ykt6Q9CQW1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ykt6Q9CQW1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ykt6Q9CQW1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ykt6Q9CQW1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ykt6Q9CQW1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ykt6Q9CQW1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms