Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS2

Nop10, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3, mousemouse

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Length 64 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop10Q9CQS2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nop10Q9CQS2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Nop10Q9CQS2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop10Q9CQS2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop10Q9CQS2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop10Q9CQS2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop10Q9CQS2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop10Q9CQS2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop10Q9CQS2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop10Q9CQS2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop10Q9CQS2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop10Q9CQS2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop10Q9CQS2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop10Q9CQS2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nop10Q9CQS2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nop10Q9CQS2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop10Q9CQS2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop10Q9CQS2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop10Q9CQS2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop10Q9CQS2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop10Q9CQS2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop10Q9CQS2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop10Q9CQS2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms