Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rdm1Q9CQK3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rdm1Q9CQK3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rdm1Q9CQK3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rdm1Q9CQK3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Rdm1Q9CQK3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rdm1Q9CQK3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rdm1Q9CQK3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rdm1Q9CQK3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rdm1Q9CQK3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rdm1Q9CQK3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rdm1Q9CQK3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rdm1Q9CQK3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rdm1Q9CQK3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rdm1Q9CQK3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rdm1Q9CQK3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rdm1Q9CQK3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rdm1Q9CQK3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rdm1Q9CQK3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rdm1Q9CQK3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rdm1Q9CQK3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Rdm1Q9CQK3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rdm1Q9CQK3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rdm1Q9CQK3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rdm1Q9CQK3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rdm1Q9CQK3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rdm1Q9CQK3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rdm1Q9CQK3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rdm1Q9CQK3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rdm1Q9CQK3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rdm1Q9CQK3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rdm1Q9CQK3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rdm1Q9CQK3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rdm1Q9CQK3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rdm1Q9CQK3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rdm1Q9CQK3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rdm1Q9CQK3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rdm1Q9CQK3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rdm1Q9CQK3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rdm1Q9CQK3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rdm1Q9CQK3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rdm1Q9CQK3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rdm1Q9CQK3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rdm1Q9CQK3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rdm1Q9CQK3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rdm1Q9CQK3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rdm1Q9CQK3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rdm1Q9CQK3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rdm1Q9CQK3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Rdm1Q9CQK3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Rdm1Q9CQK3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rdm1Q9CQK3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rdm1Q9CQK3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rdm1Q9CQK3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rdm1Q9CQK3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rdm1Q9CQK3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rdm1Q9CQK3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rdm1Q9CQK3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rdm1Q9CQK3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rdm1Q9CQK3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rdm1Q9CQK3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rdm1Q9CQK3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rdm1Q9CQK3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rdm1Q9CQK3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rdm1Q9CQK3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rdm1Q9CQK3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rdm1Q9CQK3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rdm1Q9CQK3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rdm1Q9CQK3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rdm1Q9CQK3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rdm1Q9CQK3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rdm1Q9CQK3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rdm1Q9CQK3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rdm1Q9CQK3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rdm1Q9CQK3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rdm1Q9CQK3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rdm1Q9CQK3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Rdm1Q9CQK3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rdm1Q9CQK3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rdm1Q9CQK3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rdm1Q9CQK3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rdm1Q9CQK3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rdm1Q9CQK3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rdm1Q9CQK3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rdm1Q9CQK3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rdm1Q9CQK3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rdm1Q9CQK3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rdm1Q9CQK3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rdm1Q9CQK3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rdm1Q9CQK3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rdm1Q9CQK3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rdm1Q9CQK3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rdm1Q9CQK3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rdm1Q9CQK3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rdm1Q9CQK3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rdm1Q9CQK3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rdm1Q9CQK3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rdm1Q9CQK3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rdm1Q9CQK3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rdm1Q9CQK3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms