Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ndufb9Q9CQJ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ndufb9Q9CQJ8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ndufb9Q9CQJ8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ndufb9Q9CQJ8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ndufb9Q9CQJ8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ndufb9Q9CQJ8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ndufb9Q9CQJ8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ndufb9Q9CQJ8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ndufb9Q9CQJ8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ndufb9Q9CQJ8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ndufb9Q9CQJ8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ndufb9Q9CQJ8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ndufb9Q9CQJ8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ndufb9Q9CQJ8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ndufb9Q9CQJ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ndufb9Q9CQJ8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ndufb9Q9CQJ8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ndufb9Q9CQJ8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ndufb9Q9CQJ8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ndufb9Q9CQJ8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ndufb9Q9CQJ8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ndufb9Q9CQJ8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ndufb9Q9CQJ8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ndufb9Q9CQJ8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ndufb9Q9CQJ8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ndufb9Q9CQJ8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ndufb9Q9CQJ8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ndufb9Q9CQJ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ndufb9Q9CQJ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ndufb9Q9CQJ8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ndufb9Q9CQJ8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ndufb9Q9CQJ8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ndufb9Q9CQJ8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ndufb9Q9CQJ8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ndufb9Q9CQJ8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ndufb9Q9CQJ8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ndufb9Q9CQJ8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ndufb9Q9CQJ8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ndufb9Q9CQJ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ndufb9Q9CQJ8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ndufb9Q9CQJ8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ndufb9Q9CQJ8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ndufb9Q9CQJ8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ndufb9Q9CQJ8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ndufb9Q9CQJ8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ndufb9Q9CQJ8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ndufb9Q9CQJ8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ndufb9Q9CQJ8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ndufb9Q9CQJ8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ndufb9Q9CQJ8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ndufb9Q9CQJ8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ndufb9Q9CQJ8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ndufb9Q9CQJ8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ndufb9Q9CQJ8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ndufb9Q9CQJ8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ndufb9Q9CQJ8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ndufb9Q9CQJ8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ndufb9Q9CQJ8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ndufb9Q9CQJ8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ndufb9Q9CQJ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ndufb9Q9CQJ8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ndufb9Q9CQJ8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ndufb9Q9CQJ8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ndufb9Q9CQJ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms