Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufb5Q9CQH3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufb5Q9CQH3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufb5Q9CQH3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufb5Q9CQH3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufb5Q9CQH3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ndufb5Q9CQH3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ndufb5Q9CQH3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ndufb5Q9CQH3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufb5Q9CQH3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufb5Q9CQH3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufb5Q9CQH3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufb5Q9CQH3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndufb5Q9CQH3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndufb5Q9CQH3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndufb5Q9CQH3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndufb5Q9CQH3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufb5Q9CQH3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufb5Q9CQH3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufb5Q9CQH3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufb5Q9CQH3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufb5Q9CQH3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufb5Q9CQH3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufb5Q9CQH3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufb5Q9CQH3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndufb5Q9CQH3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndufb5Q9CQH3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufb5Q9CQH3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufb5Q9CQH3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufb5Q9CQH3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndufb5Q9CQH3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndufb5Q9CQH3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndufb5Q9CQH3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufb5Q9CQH3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufb5Q9CQH3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufb5Q9CQH3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufb5Q9CQH3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndufb5Q9CQH3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndufb5Q9CQH3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndufb5Q9CQH3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufb5Q9CQH3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndufb5Q9CQH3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufb5Q9CQH3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufb5Q9CQH3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufb5Q9CQH3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufb5Q9CQH3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufb5Q9CQH3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufb5Q9CQH3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufb5Q9CQH3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufb5Q9CQH3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufb5Q9CQH3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufb5Q9CQH3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufb5Q9CQH3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufb5Q9CQH3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufb5Q9CQH3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufb5Q9CQH3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufb5Q9CQH3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufb5Q9CQH3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufb5Q9CQH3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufb5Q9CQH3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufb5Q9CQH3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufb5Q9CQH3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufb5Q9CQH3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufb5Q9CQH3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufb5Q9CQH3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufb5Q9CQH3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufb5Q9CQH3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufb5Q9CQH3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufb5Q9CQH3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufb5Q9CQH3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufb5Q9CQH3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndufb5Q9CQH3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndufb5Q9CQH3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufb5Q9CQH3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufb5Q9CQH3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufb5Q9CQH3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufb5Q9CQH3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufb5Q9CQH3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms