Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTRAFQ9CQE8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTRAFQ9CQE8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTRAFQ9CQE8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms