Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp6v0e1Q9CQD8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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