Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
Ubl4bQ9CQ84 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
Ubl4bQ9CQ84 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Ubl4bQ9CQ84 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Ubl4bQ9CQ84 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Ubl4bQ9CQ84 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Ubl4bQ9CQ84 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Ubl4bQ9CQ84 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Ubl4bQ9CQ84 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Ubl4bQ9CQ84 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Ubl4bQ9CQ84 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Ubl4bQ9CQ84 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Ubl4bQ9CQ84 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
Ubl4bQ9CQ84 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Ubl4bQ9CQ84 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Ubl4bQ9CQ84 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
Ubl4bQ9CQ84 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Ubl4bQ9CQ84 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Ubl4bQ9CQ84 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Ubl4bQ9CQ84 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Ubl4bQ9CQ84 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Ubl4bQ9CQ84 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Ubl4bQ9CQ84 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Ubl4bQ9CQ84 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
Ubl4bQ9CQ84 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Ubl4bQ9CQ84 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
Ubl4bQ9CQ84 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Ubl4bQ9CQ84 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
Ubl4bQ9CQ84 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Ubl4bQ9CQ84 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Ubl4bQ9CQ84 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Ubl4bQ9CQ84 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Ubl4bQ9CQ84 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Ubl4bQ9CQ84 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Ubl4bQ9CQ84 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Ubl4bQ9CQ84 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Ubl4bQ9CQ84 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Ubl4bQ9CQ84 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.19
Ubl4bQ9CQ84 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
Ubl4bQ9CQ84 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
Ubl4bQ9CQ84 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Ubl4bQ9CQ84 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
Ubl4bQ9CQ84 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Ubl4bQ9CQ84 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Ubl4bQ9CQ84 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Ubl4bQ9CQ84 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Ubl4bQ9CQ84 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Ubl4bQ9CQ84 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Ubl4bQ9CQ84 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Ubl4bQ9CQ84 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Ubl4bQ9CQ84 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Ubl4bQ9CQ84 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Ubl4bQ9CQ84 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
Ubl4bQ9CQ84 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Ubl4bQ9CQ84 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Ubl4bQ9CQ84 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
Ubl4bQ9CQ84 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Ubl4bQ9CQ84 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Ubl4bQ9CQ84 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Ubl4bQ9CQ84 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
Ubl4bQ9CQ84 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Ubl4bQ9CQ84 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Ubl4bQ9CQ84 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Ubl4bQ9CQ84 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Ubl4bQ9CQ84 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Ubl4bQ9CQ84 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Ubl4bQ9CQ84 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Ubl4bQ9CQ84 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
Ubl4bQ9CQ84 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Ubl4bQ9CQ84 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Ubl4bQ9CQ84 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Ubl4bQ9CQ84 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Ubl4bQ9CQ84 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Ubl4bQ9CQ84 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Ubl4bQ9CQ84 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Ubl4bQ9CQ84 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Ubl4bQ9CQ84 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Ubl4bQ9CQ84 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Ubl4bQ9CQ84 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
Ubl4bQ9CQ84 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Ubl4bQ9CQ84 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Ubl4bQ9CQ84 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Ubl4bQ9CQ84 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Ubl4bQ9CQ84 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Ubl4bQ9CQ84 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
Ubl4bQ9CQ84 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Ubl4bQ9CQ84 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC41■■■■■ 4.15
Ubl4bQ9CQ84 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Ubl4bQ9CQ84 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
Ubl4bQ9CQ84 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
Ubl4bQ9CQ84 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Ubl4bQ9CQ84 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Ubl4bQ9CQ84 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
Ubl4bQ9CQ84 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Ubl4bQ9CQ84 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.15
Ubl4bQ9CQ84 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Ubl4bQ9CQ84 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Ubl4bQ9CQ84 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Ubl4bQ9CQ84 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Ubl4bQ9CQ84 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms