Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700029P11RikQ9CQ68 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700029P11RikQ9CQ68 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms