Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4921530L21RikQ9CQ47 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4921530L21RikQ9CQ47 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4921530L21RikQ9CQ47 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4921530L21RikQ9CQ47 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4921530L21RikQ9CQ47 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
4921530L21RikQ9CQ47 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
4921530L21RikQ9CQ47 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4921530L21RikQ9CQ47 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4921530L21RikQ9CQ47 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
4921530L21RikQ9CQ47 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4921530L21RikQ9CQ47 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4921530L21RikQ9CQ47 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4921530L21RikQ9CQ47 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4921530L21RikQ9CQ47 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4921530L21RikQ9CQ47 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4921530L21RikQ9CQ47 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4921530L21RikQ9CQ47 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4921530L21RikQ9CQ47 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4921530L21RikQ9CQ47 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4921530L21RikQ9CQ47 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4921530L21RikQ9CQ47 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4921530L21RikQ9CQ47 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4921530L21RikQ9CQ47 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4921530L21RikQ9CQ47 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.3 ms