Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ22

Lamtor1, Ragulator complex protein LAMTOR1, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamtor1Q9CQ22 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamtor1Q9CQ22 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamtor1Q9CQ22 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamtor1Q9CQ22 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamtor1Q9CQ22 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamtor1Q9CQ22 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamtor1Q9CQ22 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamtor1Q9CQ22 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamtor1Q9CQ22 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamtor1Q9CQ22 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamtor1Q9CQ22 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamtor1Q9CQ22 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamtor1Q9CQ22 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamtor1Q9CQ22 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamtor1Q9CQ22 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamtor1Q9CQ22 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamtor1Q9CQ22 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms